L’action entreprise
Met’Connect propose de créer deux pôles de référence à Nice et à Marseille pour l’étude du métabolisme tumoral afin de partager l’expertise des laboratoires travaillant dans ce domaine avec la communauté scientifique de la région Sud. L’accès à Met’Connect, en particulier aux équipes qui ne possèdent pas d’expertise en métabolisme tumoral, permettra de lever les blocages techniques, conceptuels qui, trop souvent, empêchent le développement de nouveaux projets au sein d’équipes dont les thématiques sont, a priori, éloignées du domaine du métabolisme tumoral. Ainsi, l’émergence de ces nouveaux projets permettra d’intégrer l’étude du métabolisme tumoral à des projets déjà existants, apportant une plus-value aux porteurs de projets et renforçant les collaborations entre chercheurs de la région Sud. Cette structuration de nouveaux projets et nouveaux réseaux de chercheurs autour du métabolisme tumoral, à travers une structure telle que Met’Connect, sera unique en France.
Les objectifs de Met’Connect sont de :
- Structurer et renforcer les compétences scientifiques et techniques concernant l’étude du métabolisme des cellules cancéreuses en région Sud.
- Apporter des solutions expérimentales à des interrogations sur le métabolisme tumoral.
- Développer une approche bio-informatique pour le profilage métabolique des échantillons sur la base de données omiques multiples.
- Faciliter l’accès à des plateformes d’exploration du métabolome tumoral.
L’offre du réseau
Les porteurs de projet auront un membre du conseil scientifique référent au sein de Met’Connect qui leur proposera des solutions en termes de conception d’expériences (protocoles, réactifs, kits…), de réalisation pratique des expériences (formation à l’utilisation des appareils, mise au point…), d’analyses bio-informatiques de données omiques, en fonction des objectifs à atteindre. Pour cela Met’Connect propose :
- un accès facilité aux équipements basés sur le site du C3M (Nice) ou CRCM (Marseille) avec assistance technique sur les appareils composant les plateformes d’exploration métabolique des deux centres. Ces équipements comprennent des analyseurs Agilent SeaHorse (lien plaquette), des analyseurs biochimiques (YSI 2900, System C Industrie, lien plaquette), un Omnilog (lien plaquette), des chambres hypoxiques (In Vivo 500, ABE, lien plaquette).
- une aide à l’analyse des données dites « Omiques » grâce aux ingénieurs experts en bio-informatique. Des méthodes adaptées seront proposées pour réduire les biais et variations expérimentales, pour visualiser les profils métaboliques des échantillons tumoraux (analyses de composants principaux, analyses d’enrichissement, analyses intégrées de données multi-omiques telles que transcriptomiques, protéomiques, et métabolomiques). La conception de rapports d’analyse (format HTML, Excel) permettra aux porteurs de projets de poursuivre de manière autonome leur exploration de jeux de données omiques.
Le réseau engagé
Met’Connect est portée par les référents de l’action et par un comité scientifique composé de chercheurs et responsables de plateformes sur les sites Niçois et Marseillais.
Référents : Dr. Frédéric BOST (C3M), associée Dr. Nathalie MAZURE (C3M) ; Dr Sophie VASSEUR (CRCM), associée Dr. Fabienne GUILLAUMOND (CRCM).
Conseil Scientifique : Rafael ARGUELLO (CIML), Ghislain BIDAULT (CRCM), Fabienne BRENET (CRCM), Alice CARRIER (CRCM), Johanna CHICHE (C3M), Delphine DEBAYLE (IPMC), Mohamed MEHIRI (ICN), Jacques NUNES (CRCM°, Jean-Ehrland RICCI (C3M), Stéphane ROCCHI (C3M).
Le personnel dédié à Met’Connect : la réalisation des projets, développés au sein de Met’Connect, sera effectuée par les ingénieurs dédiés, experts, coordonnés par une gestionnaire de projets :
- Constance NAU (Nice) : ingénieure en biologie
- Paraskevi KOUSTERIDOU (Marseille) : gestionnaire de projets/ingénieure en bio-informatique
- Pierre BERTRAND (Marseille) : ingénieur en bio-informatique
Formulaire d’accès à la plateforme à renseigner et à renvoyer par mail à ces adresses : metconnect.crcm@inserm.fr / vanessa.zepponi@univ-amu.fr
